Фильм Пуля-дура 2: Агент почти не виден рассказывает историю, где романтическое знакомство с очаровательной женщиной оборачивается чередой опасностей. Частный сыщик Боб Уточкин едва успевает перекинуться парой слов с загадочной красавицей, как над ним расправляется автоматная очередь, и он оказывается прикован к палате больницы. Чтобы вернуть расследование в ход, ему приходится прибегнуть к помощи двоюродного брата Стаса, который живет в Канаде. У Стаса та же специальность: шпионаж и встречи с угрозами физической силы. Их расследование приводит к серии убийств, начавшихся с отца той самой неразговорчивой девушки и выводящих к теневому рынку драгметаллов. Но к развязке становится ясно: истинная причина убийств отца не связанa с подпольной продажей драгоценностей. Злоумышленники планируют отравить водоснабжение Москвы, ставя под угрозу жизни миллионов людей. Финальная схватка превращается в крепкое единство Боба и Стаса: они объединяют усилия, чтобы остановить террористов и предотвратить катастрофу.