Сюжет фильма разворачивается в альтернативной Японии, где город Сугомори постепенно опускается в тень упадка и забвения. Главный герой — замкнутый, нелюдимый юноша, которому судьба улыбнулась необычной возможностью: он стал избранным. По замыслу эксперимента избранных разделяют на команды по восемь человек, и они становятся «связанными» в рамках программы под названием «кизнайверы». В его составе собрались люди самой разной природы — от стеснительных и тихих до бунтарских и импульсивных. Но они не разъединяются: работают, спорят, придумывают совместные развлечения и радости, и даже ранения одного они переживают вместе — таков эффект коллективизма. С появлением этой связывающей системы городские жители начинают заметно исчезать — население сокращается, а герои тем временем держат оборону ради мира. Они стремятся не просто победить врагов, но и предотвратить резкое разрушение жизни людей: ведь если кто-то серьёзно пострадает, за это расплатится весь город. В этом и состоит напряжение фильма: борьба за безопасность и сохранение человечности в условиях жесткой программы.