Разочарованный недавними героическими триумфами Супермена и нарастающей звездой его имени, Лекс Лютор заключает опасный союз с могущественным компьютерным злодеем Брэйниаком. В погоне за победой над непобедимым героем он запускает план, в основе которого лежит передовое оружие, созданное из редкой породы, добытой в самых дальних глубинах космоса. Зловещий гений перепрограммирует Брэйниака, наделяя его новыми способностями и превращая в непреодолимого противника, способного прорвать защиту героя. Появляется угроза, с которой Супермен сталкивается на новом, гораздо более разрушительном уровне: разрушение порядка на улицах города и риск для миллионов жизней, угрожающий перерасти в конфликт всей галактики. В противостоянии герой вынужден искать нестандартные решения, полагаться на смекалку и доверять помогателям, которых ранее мало ожидал видеть рядом. По мере раскрутки сюжета становятся очевидны скрытые мотивы и цена власти, а Супермену приходится балансировать между силой, мудростью и верностью идеалам справедливости, чтобы остановить план врагов и защитить невинных.