Дафна вместе с друзьями отправляется в Японию на турнир по боевым искусствам. Вскоре на острове, где проходит состязание, появляется армия ниндзя во главе с призраком Чёрного самурая. Команда Скуби-Ду должна помешать злодею украсть свиток судьбы.