Это первый полнометражный анимационный фильм из серии Бэтмен: Будущее. В центре сюжета — противостояние поколений: и старый, и юный Бэтмэн вынуждены держаться на грани смеха и отчаянной серьёзности, ведь возвращается самый опасный преступник всех времен, прибывший из прошлого, чтобы отомстить молодому Терри МакГиннису, Брюсу Уэйну и всему Готэму. Подлый, смертельно опасный и, по слухам, почти бессмертный Король преступного мира снова появляется, чтобы сеять хаос и разрушение. В попытках разгадать загадку Джокера Терри МакГиннис ныряет в расследование, которое приводит его к самым глубоким тайнам и старым воспоминаниям. Он раскрывает великое тайное о вечной ночи последнего столкновения Бэтмена с Джокером и осознает, что на самом деле произошло тогда. Брюс Уэйн, оказавшийся на грани гибели под ударами коварного врага, становится ключевой частью этого урока истории о цене борьбы с тьмой и о том, чем стоит жертвовать ради города.
Оригинальная версия фильма отличалась от той, что вышла на экраны, гораздо большим количеством сцен насилия. Одной из вырезанных сцен, в частности, стал эпизод, в котором юный Робин — Тим Дрейк убивает кого-то из ружья для подводной охоты. В свете массового убийства в школе «Колумбайн» 20 апреля 1999 года, многие диалоги и сцены насилия были изменены или вырезаны, так что мультфильму был присвоен рейтинг PG (детям рекомендуется смотреть фильм с родителями). Первоначальный вариант с рейтингом PG-13 (не рекомендуется детям до 13 лет) был впоследствии выпущен на DVD.