Фильм Белка и Стрелка: Карибская тайна разворачивается у берегов Кубы и знакомит с загадочной аномалией: гигантский водяной вихрь затягивает за собой воду, опустошая океан. По приказу советского командования Белка и Стрелка отправляются на разведку к острову братских народов, чтобы выяснить источник явления и найти способы его остановить. Яркая Куба предстает перед героями во всей своей цветности — лазурное море, красочные фасады и манящие подводные тайны, скрытые в глубинах. Четвероногим исследователям и их команде предстоит пройти через серию опасных испытаний, которые не только приблизят их к разгадке кубинской аномалии, но и проверят прочность дружбы. В их путешествии их ждут неожиданные встречи с подводным миром, смелые решения и слаженная работа всей команды. В конце концов они поймут, что настоящее море хранит не только загадки, но и силу доверия, взаимопомощи и преданной дружбы.