После свадьбы капитана Уильяма Райкера и советницы Дианы Трой экипаж «Энтерпрайза» сталкивается с непривычной загадкой: на близкой нейтральной планете они уловили необычный позитронный сигнал и направляются к месту, чтобы выяснить его источник. В ходе разборки они наталкиваются на B-4 — андроида, который уступает Дейту по уровню развития и представляет собой прототип, созданный доктором Сунгом. Тайна остаётся неразгаданной, пока в этот же момент адмирал Джейнвей не отдает приказ повернуть корабль к Ромулусу. Там произошёл переворот, свергнувший сенат под руководством Шинзона и его последователей, и теперь ромуланцы держат власть над своей звездной империей. По прибытии «Энтерпрайза» экипаж сталкивается не только с одним из самых мощных судов, которые им приходилось видеть, но и с мрачной правдой о младшем правителе Ромуланской империи. Этот лидер намерен применить убийственную силу, чтобы уничтожить всю живую материю на Земле — главной планете Федерации.
В отличие от взрывов, таран двух звездолётов не был продуктом компьютерных технологий. Съёмочная группа подвесила обе модели, ударила одну о другую и сняла происходящее в режиме замедленной съёмки.
Практически все сцены полётов на шаттле «Энтерпрайза» сэр Патрик Стюарт выполнял самостоятельно.
В первоначальной версии сценария предполагалось, что сэр Патрик Стюарт сыграет и капитана Пикара, и Шинзона, а последняя битва между звездолётами под их командованием произойдёт на орбите Земли.
В одном из интервью после выхода фильма Том Харди рассказывал, что отнёсся к работе у режиссёра Стюарта Бейрда со всей серьёзностью, в надежде на то, что роль его прославит. Коммерческий провал фильма и реакция на него поклонников франшизы привели к тому, что Харди расстался с подругой, начал злоупотреблять алкоголем и даже стал подумывать о том, чтобы свести счёты с жизнью. Перестал он расстраиваться из-за этого фильма, только когда взял себя в руки и снялся у Николаса Виндинга Рефна в криминальной драме « Бронсон » (2008).
Прощальную сцену с капитаном Пикаром пришлось переснимать, так как сэр Патрик Стюарт неожиданно расплакался.