В далёком будущем полярные льды растаяли, и весь земной шар окутал бескрайний океан. Теперь суша почти не встречается на горизонте, а легенды о существовании пригодной для жизни земли живут только в слухах, которые сложно проверить. На плавучий атолл прибывает Моряк — человек, чьё дело связано с добычей и продажей того, что удаётся найти под водой. Он намерен продать найденное «сокровище» в виде участков суши, но его тут же принимают за шпиона курильщиков — самой опасной клановой силы Водного мира. Чтобы выбраться живым, Моряку помогает пара странников: Хелен и маленькая Энола. Вместе они действуют хитро и смело, обходя ловушки и затаив дыхание. Их спасение оборачивается загадкой: Хелен просит отвезти её и девочку к земле, обещая взамен возможность начать новую жизнь вдали от притеснений и риска быть пойманными. Так начинается путь к суше, где грезы о свободе и человеческом городе могут ещё найти своё место в этом затопленном мире.
Фильм сильно пострадал от пиратства: задолго до выхода на экраны широко разошлись пиратские копии — фильм был украден практически с монтажного стола, у пиратской версии была другая концовка.
Изначально Анна Пэкуин должна была сыграть Энолу.
Остатки города, которые герои видят под водой, — Денвер.
На момент выхода картины «Водный мир» стал самым дорогим фильмом в истории.
Портрет на стене, которому Дьякон обращается как Святой Джо, — это Джозеф Хэзелвуд, капитан нефтяного танкера «Exxon Valdez», потерпевшего крушение у берегов Аляски, что привело к утечке миллионов литров нефти.