Джейсон Борн мечтал только о том, чтобы исчезнуть и начать новую жизнь без преследования. Но на пути к тихой и обычной жизни стоит неумолимый механизм власти: высшее командование ЦРУ не собирается сдавать следы своих сомнительных дел и продолжает охоту за ним. После рискованного побега из России он снова вынужден копаться в своей памяти, чтобы нащупать истину о прошлом и понять, какие силы стоят за тайным проектом, тесно связанным с его именем. Борн натыкается на британского журналиста, который получил данные от информатора внутри разведки — сведения, способные разрушить ходы операции и обернуться ударом по тем, кто держит власть над секретами. Погоня становится не просто стремлением к свободе, но и расследованием о том, кто и зачем держит Борна под контролем. В этой сети лжи, манипуляций и опасных союзов каждый шаг приближает героя к разгадке, однако раскрытие правды несёт риск не только для него, но и для тех, кто попал в зону поражения их скрытых планов.
Съемочная группа фильма насчитывала 250 человек, так что при перелетах приходилось фрахтовать отдельный самолет.
Чтобы снять погоню на улицах Танжера, камеры подвесили на кабель, протянутый над крышами домов.
Сцена, в которой Борн спрашивает Никки о своем прошлом, снималась на шоссе к юго-западу от Мадрида.
Съёмочной группе не удалось закрыть хотя бы ненадолго вокзал Ватерлоо, поэтому в кадре видно, что пешеходы рассматривают и показывают пальцами на съёмочную камеру.
Среди файлов, которые Борн ворует из офиса ЦРУ, есть файл ликвидированного агента, на котором стоит фото актёра Ричарда Чемберлена, исполнившего роль Борна в телепостановке 1988 года.