Инесс, муза знаменитого портретиста Франсиско Гойи, оказывается во власти инквизиции и брошена в темницу. В отчаянии сам мастер обращается за поддержкой к своему другу — преданному священнику Лоренцо. Их доверительные отношения начинают подвергаться суровым испытаниям: давление внешних сил, сомнения и запреты постепенно расталкивают границы между ними. Трио Инесс, Гойя и Лоренцо вынуждено пережить последствия своих решений, которые радикально меняют их судьбы. Гойя старается сохранить правду в своем искусстве и свободу творить, не забывая о тех, кого любит, а Лоренцо, оказавшись на распутье между служебной верой и состраданием к близким, рискует потерять свою опору. Инквизиция не щадит ни его окружение, ни самого художника, чьи полотна становятся зеркалом вовлеченности и риска. Под давлением обстоятельств их связь трещит, но в итоге заставляет каждого из них осознать цену выбора и цену искусства. Это история о силе творчества и власти, о голосе совести и призраках прошлого, которые не оставляют героев в покое.
Милош Форман пригласил Натали Портман на роль Инес, после того как заметил ее сходство с девушкой, изображенной на картине Франсиско Гойи «Молочница из Бордо» (1825-27).
Финальный кадр фильма — это автопортрет Гойи, написанный в 1815 году.