Фильм поставлен по одноимённой книге известного американского детского писателя Э.Б. Уайта, впервые опубликованной в 1952 году.
В дублированной французской версии фильма Шарлотту озвучила известная актриса и модель Летиция Каста.
На роль Фёрн, доставшуюся Дакоте Фаннинг, пробовалась также Хлоя Гринфилд.
Из-за того, что поросята росли не по дням, а по часам на съемочной площадке было задействовано 47 представителей свиного племени. При этом каждый поросёнок был обучен только одному небольшому трюку.
Паучиха Шарлотта представляется как Шарлотта Эй Каватика, что отсылает зрителя к научному названию амбарного паука Araneus Cavaticus. Ранее использовалось это же название в единственном числе, Araneus Cavatica.
Тим Бёртон отказался от предложения занять место режиссёра картины с тем, чтобы спокойно работать над своим собственным проектом «Суини Тодд, демон-парикмахер с Флит-Стрит» (2007).
Из соображений безопасности ранние копии с фильмом доставлялись под названием «Бекон».
Композитор Дэнни Элфман ради написания музыки к «Паутине Шарлотты» отказался от работы над «Человеком-пауком 3» (2007).
Книга, которую Фёрн читает животным в амбаре, это известная сказка Роберта МакКлоски «Дайте дорогу утятам».
Пара ворон получили свои имена Элвин и Брукс в честь автора книги, полное имя которого Элвин Брукс Уайт.
Съёмки картины главным образом прошли в австралийском штате Виктория, неподалёку от Мельбурна и в его предместьях. Сцены сельской ярмарки была снята в пригороде Мельбурна Гейдельберг на футбольном поле местной команды. Поскольку по сценарию действие должно было происходить осенью, находящиеся поблизости деревья были покрашены нетоксичной оранжевой и жёлтой краской. Также вместо реальных людей на каруселях были задействованы специально изготовленные куклы-манекены с тщательно выполненными лицами.