Фильм снят по роману Митча Каллина Пчёлы мистера Холмса (2005).
Готовясь к съёмкам, Иэн МакКеллен посещал курсы пчеловодства, организованные London Honey Company. В процессе съёмок его не ужалила ни одна пчела.
В одном из фильмов о себе, которые смотрит Шерлок Холмс, его роль исполняет Николас Роу. Роу действительно сыграл знаменитого сыщика в фильме Молодой Шерлок Холмс (1985).
Вначале фильм собирались назвать Пчёлы мистера Холмса, как и роман Митча Каллина, по которому он поставлен, но затем создатели фильма предпочли более простое название Мистер Холмс.
Готовясь к съёмкам в фильме, Иэн МакКеллен не стал перечитывать рассказы о своём персонаже. Он как-то сказал, что с него хватило работы в трилогии Властелин колец, когда он внимательно ознакомился с текстом романа, а затем в процессе съёмок никак не мог сосредоточиться на роли, когда сюжетная линия хоть в чём-то отступала от первоисточника.
Иэн МакКеллен заявил, что ему было несложно представить себе Шерлока Холмса в жизни, так как события фильма в основном разворачиваются в годы его собственной жизни, поэтому он вполне мог бы встретиться с сыщиком в 1947, когда был ещё, как Роджер, ребёнком.
Кабинет таксидермиста, в который Энн заглядывает через окно, принадлежит Эмброузу Чеппллу. В фильме Альфреда Хичкока Человек, который слишком много знал (1955) Джеймс Стюарт ищет похищенного сына у таксидермиста по имени Эмброуз Чепплл.
Иэн МакКеллен сказал в одном из интервью, что костюм ему пошили из очень неудачного материала, который в самых разных местах натирал кожу. Из-за этого он не уверен, что захочет играть в продолжениях фильма, если таковые будут снимать.
Сыгравший инспектора Гилберта актёр Филип Дэвис играет в первой серии Шерлока (2010) таксиста.
Это четвёртая совместная работа актрисы Лоры Линни и режиссёра Билла Кондона.
В фильме Боги и монстры (1998) Билл Кондон уже снимал Иэна МакКеллена в роли старика, старающегося возродить былую остроту ума. Игра Лоры Линни в Мистере Холмсе перекликается с игрой актрисы Линн Редгрейв в фильме Боги и монстры.
Иэн МакКеллен и Хироюки Санада вместе играли в фильме франшизы Люди-Икс Росомаха: Бессмертный (2013), хотя в кадре и не встречались.
Сэр Иэн МакКеллен, исполнитель роли Шерлока Холмса, и исполнительница роли мадам Ширмер актриса Фрэнсис де ла Тур вместе играли в британской комедии Грешники (2013).
В фильме Николаса Роу Молодой Шерлок Холмс роль Ватсона озвучил сэр Майкл Хордерн, тот самый, что когда-то играл Гэндальфа в радиопостановке Властелин колец на BBC. Исполняя роль Гэндальфа, Иэн МакКеллен работал с Мартином Фрименом, который играл Ватсона в фильме Шерлок (2010). Роль молодого Ватсона исполнил Алан Кокс, чей отец Брайан Кокс снимался с МакКелленом в фильме Люди Икс 2 (2003).
Режиссёр Билл Кондон снял фильм Пятая власть (2013), в котором сыграл один из исполнителей роли Шерлока актёр Бенедикт Камбербэтч.
Съёмки эпизодов в клубе Диоген проходили в Хэтфилд-хаусе в городе Хартфордшир. В Хэтфилд-хаусе также проходили съёмки фильма Шерлок Холмс (2009), где он изображал дом мистера Томаса, а также сериала Мисс Марпл Агаты Кристи (2004) о занимающейся расследованиями даме, героине классических детективных романов.
Премьера фильма состоялась на 65-м Берлинском международном кинофестивале в феврале 2015 года.
Иэн МакКеллен снялся вместе с Бенедиктом Камбербэтчем и Мартином Фрименом в трилогии Хоббит. Камбербэтч и Фримен исполнили роли Шерлока Холмса и доктора Джона Ватсона в сериале Шерлок (2010).
Роман Пчёлы мистера Холмса, взятый за основу в работе над фильмом, вышел также в виде аудиокниги. Текст читает Саймон Джонс. Джонс сыграл роль Артура Дента в телевизионной адаптации романа Автостопом по галактике (1979). В фильме Автостопом по галактике (2005) эту роль исполнил Мартин Фримен, который сыграл доктора Джона Ватсона в телесериале Шерлок (2010).
Иэн МакКеллен сыграл вместе со своим другом Дереком Джекоби в фильме Грешники (2013). В многих аудиокнигах о приключениях Шерлока Холмса звучит голос Джекоби. Учитывая, что рассказ в них идёт от лица доктора Джона Ватсона, можно сказать, что и Дереку Джекоби довелось сыграть этот персонаж.
В некоторых эпизодах на голову Холмса гримом нанесли возрастную пигментацию, чтобы показать процесс старения и наступление старческого слабоумия.