Сюжет
В недалёком будущем человечество сталкивается с новой угрозой, воплощённой могущественной Океанической Империей, которая подчинила себе ключевые районы мирового океана благодаря передовым военным технологиям. Чтобы противостоять этому давлению, многие страны наращивают оборонный потенциал, особенно вооружённые силы под водой. В центре истории появляется японский проект «спасительной машины» — Суперсубмарина 99, созданная гениальным учёным по имени Оки Джузо. Сюжет следует за Оки Сусуму, ведущим инженером и мозговым центром SS-99, а также за остальными членами экипажа и их путешествиями, полными опасностей и дерзких операций. Их главная задача — спасти планету и вернуть контроль над океанами, столкнувшись с непредсказуемыми опасностями и моральными испытаниями. Вне зависимости от расстояний и препятствий, команда СС-99 идёт к своей цели — сохранить Землю от захвата и привести мир к устойчивому миру на морях.