Главная история фильма «Призрак в доспехах: Синдром одиночки» 2002 года сосредоточена на Майоре Мотоко Кусанаги, Бато и остальных сотрудниках загадочного Девятого отдела, которые пытаются предотвратить международный кризис и спасти заложников. Их миссия разворачивается сразу по нескольким направлениям: они ведут борьбу с угрозой, способной перерасти в глобальный конфликт; преследуют самоуверенный танк, который внезапно покинул учебный полигон и продолжает движение по городу без команды; и распутывают череду загадочных самоубийств андроидов устаревшей модели, чьи смерти поднимают глубокие вопросы о жизни, сознании и границах между человеком и машиной. По мере развития сюжета личная драма усиливается: гибель старого друга Тогусы вынуждает оперативников заново оценить свои принципы и методы, а также заставляет их углубиться в расследование вокруг таинственного хакера по кличке Смеющийся Человек, чьи манипуляции заставляют их пересмотреть понятие свободы воли и власти технологий.
Мультсериал снят по мотивам манги Масамунэ Сиро «Призрак в доспехах» (Ghost in the Shell, 1991).
Песни Inner Universe и Rise написаны для сериала певицей российского происхождения Оригой (Ольгой Яковлевой) совместно с одним из самых успешных современных японских композиторов Ёко Канно.