Далёкое будущее, год 2032. Технологический прогресс достиг таких высот, что люди живут бок о бок с киборгами и роботами, а повседневную жизнь всё чаще опутывают автоматизированные устройства. Бато служит детективом в отделе по борьбе с терроризмом. Его тело — гибрид биологии и механики: искусственные руки, ноги и целый ряд имплантов дополняют его. Ему осталось лишь его прежний мозг и память о Мотоко Кусанаги — о прошлом напарнике, чьё имя до сих пор не отпускает его.
Напарник Тогуса помогает Бато распутывать череду загадочных убийств, связанных с владельцами их роботов. Все пострадавшие оказались связаны с экспериментальной серией секс-андроидов, выпускаемой фирмой Locus Solus. Корпорация пытается скрыть правду: отзывает машины с рынка, умалчивает детали и пытается договориться с близкими погибших. Но Бато и Тогуса не из тех, кто легко сдается на такие условия. Они углубляются в расследование, сталкиваются с тайнами памяти и искусственного сознания, и по мере раскрытия вопросов о том, что значит быть человеком в мире, где машины становятся неотделимыми от жизни, перед ними открываются всё более сложные моральные дилеммы.