Земляне вводят в эксплуатацию новый тип боевого робота под кодовым названием «Доминион», ещё не догадываясь о смертельной угрозе, которая вскоре нависнет над человечеством. Кира Ямато и его команда решают вмешаться, пока не стало слишком поздно.