Серии умышленно пускали в эфир не по порядку. Что было показано как первая серия, в действительности было одиннадцатой серией. В конце каждой серии Харухи (её озвучивала Ая Хирано ) называла хронологически правильный номер следующей серии, а персонаж, говоривший голосом Томокадзу Сугиты, её «поправлял», называя «неверный» номер серии (тот, который шёл в порядке выхода серии в эфир). Когда в 2009 году были сняты новые серии, показ всего сериала начали заново, на этот раз уже в хронологическом порядке.
Учебное заведение списано со школы, которую посещал сценарист Нагару Танигава. После выхода сериала в эфир в школу стали стекаться толпы поклонников, и администрации пришлось даже прибегнуть к угрозам судебного преследования слишком горячих любителей франшизы.