В альтернативной реальности Британская империя подавляет треть мира, обрушивая на сопротивление свою безжалостную военную машину. В оккупированной Японии, получившей название Зона одиннадцать, вместе с младшей сестрой живет старшеклассник Лелуш — изгнанный сын императора, лишившийся матери и права на престол. По происхождению он выделяется не только родословной, но и необыкновенными умственными способностями, которые пока не нашли применения. Внезапно Лелуш оказывается втянут в разгорающееся противостояние между японскими повстанцами и британскими гарнизонами. Так он знакомится с загадочной девушкой C.C., которая дарует ему сверхъестественную силу Гиас — способность подчинять волю других людей. Надев маску и приняв псевдоним Зеро, он вступает в подпольное движение, горя желанием отомстить Британии и своему отцу. Будучи студентом Академии Ашфорд, он вынужден вести двойную жизнь, скрывая истинные цели и постоянно балансируя между долгом и темной местью.