В «Кронос»-корпорации проводятся секретные лабораторные испытания над зоаноидами — существами, способными превращаться в чудовищ. Выбившийся из-под контроля подопытный сбегает, увозя за собой три загадочных блока. Школьник по имени Сё Фукамачи наталкивается на один из артефактов и случайно активирует его, пробуждая скрытую силу. В мгновение ока над юношей распускается биологическая броня с мощным арсеналом, и он превращается в Гайвера — носителя биоударного оружия. Но новый облик приносит не только защиту: броня черпает энергию из таинственных источников, а корпорация Кронос начинает преследование за теми элементами силы. В руках у него оказывается ключ к тому, кем он является и зачем появился в этом мире — любая его попытка двигаться вперёд сопровождается новым конфликтом между наукой, властью и собственной судьбой. Он сталкивается с мощными противниками и узнаёт цену силы.