Действие фильма «Евангелион: Смерть и перерождение» разворачивается вокруг юного пилота гигантского боевого аппарата, чья судьба тесно переплетается с будущим человечества. 14-летний Синдзи Икари — сын главы загадочной организации NERV — оказывается втянутым в мир, где наука, военная техника и таинственные силы сталкиваются в противостоянии с неизвестной угрозой. Он замкнут, редко бывает откровенным с окружающими и тяжелее переживает расставание с отцом, что добавляет ему тревоги и сомнений, когда он вынужден вступать в роль пилота. Подобные испытания переживают и другие юные пилоты, а также взрослые сотрудники учреждения: давление ответственности, страхи и личные раны накладывают отпечаток на их поведение и мотивацию. Руководство же держит в секрете подлинный смысл проекта, предлагая видимые задачи и лояльность, одновременно скрывая истинные цели за стенами корпорации. Фильм сочетает психологическую драму взросления с эпическими батальными сценами и странными тайнами, заставляя героев пересматривать свои мечты, доверие и средства выживания, на фоне невероятно опасной реальности.