Прошло пять лет с тех пор, как Бен Теннисон впервые увидел Омнитрикс и превратился в защитника планеты. Сейчас ему пятнадцать, и он обычный подросток, давно забывший о резке времени и чужих технологиях. Его подвиги и внезапные превращения кажутся далеким прошлым, а Омнитрикс лежит без дела в дальнем ящике. После победы над грозным Вилгаксом он снял часы и старался жить как обычный подросток, избегая опасностей и секретов. Но покой слишком скоро исчезает: дедушка Макс бесследно исчезает. Бен спешит рассказать об этом своей кузине Гвен, и вдвоём они решают остановить исчезновение. Он решает снова надеть Омнитрикс, чтобы узнать, что случилось с дедом и зачем молчат те, кто должен объяснить. В ходе расследования они понимают, что инопланетяне снова замышляют нечто ужасное. Появляется новая раса пришельцев, чьи планы выходят за рамки одной планеты: они хотят уничтожить жизнь не только на Земле, но и во всей Галактике.